机械设计及理论研究所起源于1958年创办的建筑与筑路机械专业。在学科调整时，与机械学、工程图学、振动冲击及噪声控制合并形成目前的专业学科。该学科1993年获得博士授予权，1996年确定为“211”重点建设学科，1999年建立了博士后流动站，2001年被评为上海市重点建设学科，是“长江计划”特聘教授的设岗单位。
    主要研究方向有：机械创新设计方法与理论、机械动态设计及其分析与试验、工程机械及其关键技术、机械控制与信息处理技术、工业工程（仅招收博士研究生）